В четверг 8 сентября 2011 года в 17-20 в аудитории 2448 состоится заседание научного семинара кафедры системного программирования.
С докладом выступит Вяткина Кира Вадимовна (Академический университет).
Тема доклада:
Эффективные методы идентификации масс-спектров с использованием тегов
Аннотация доклада:
Одним из наиболее перспективных направлений современной биоинформатики является масс-спектрометрия -- наука, изучающая строение вещества на основе его масс-спектра. К важнейшим ее задачам относится идентификация масс-спектра в базе данных, суть которой заключается в находжении для данного масс-спектра наиболее хорошо соответствующего ему протеина или протеинов. Современные масс-спектрометры способны выдавать по миллиону масс-спектров в день; количество же известных протеинов составляет порядка десяти миллионов.
Для обработки столь внушительных объемов данных необходимы, очевидно, быстрые
и надежные алгоритмы.
В докладе будут обсуждаться эффективные методы идентификации и анализа масс-спектров, полученных по технологиям bottom-up и top-down, в основе которых лежит использование тегов -- коротких последовательностей аминокислот.
Стипендия А.Н. Терехова
