Лекция проф.А.П.Козлова по проблемам Биоинформатики

Анонс предстоящей лекции:

Современная биология немыслима без математики и высокопроизводительных программ. Именно поэтому ресурсоёмкие процессы вроде сборки генома или BLAST (basic local alighnment tool) стараются вынести на облачные ресурсы, поскольку спрос на них растет, а позволить себе персональные компьютеры способные выполнять такие программы может далеко не каждая лаборатория. В нашей работе мы использовали ресурс NCBI HomoloGene, который делает BLAST для группы геномов и выполнить подобный анализ на персональном компьютере было бы крайне затруднительно, хотя хотелось бы, чтобы каждый биолог получил возможность моделирования на своем рабочем месте.

Теоретическая биология отличается от физики тем, что ее константы имеют структурный характер, что затрудняет применение математических методов. В биологии накопилось много парадоксов и нерешенных проблем, для объяснения которых необходимо создание новых биологических теорий. В течение многих лет автор работает над созданием теории эволюционной роли опухолей. Согласно этой теории, прогрессивная эволюция осуществляется путем неофункционализации опухолей в результате экспрессии в опухолях эволюционно новых генов.

В последние годы в результате развития методов биоинформатики и увеличения числа секвенированных геномов автору и его коллегам удалось подтвердить некоторые нетривиальные предсказания теории. Рассмотрению этих достижений будет посвящен доклад.

Немного о лекторе:

С 1972 по 1980 г. работал в НИИ онкологии им. Н.Н. Петрова, где защитил кандидатскую диссертацию. В 1978 г. получил грант Международного агентства по изучению рака на стажировку в Национальном институте рака (США) в лаборатории д-ра Роберта Галло. Проф. Козлов был руководителем отдела в НИИ особо чистых биопрепаратов (Санкт-Петербург), организовал несколько лабораторий и много исследовательских программ, участвовал в разработке федерального российского проекта по созданию вакцины против ВИЧ, одним из руководителей которой является и сейчас, совмещая должности директора Биомедицинского центра, председателя ежегодной международной конференции «СПИД, рак и общественное здоровье», главного редактора журнала «СПИД, рак и общественное здоровье» и профессора биологии СПбГУ, а также руководителя нескольких престижных международных проектов. На протяжении нескольких лет А.П. Козлов являлся членом Экспертной комиссии при Комитете по образованию и науке Государственной Думы. За исследования в области иммунологии и биотехнологии А.П. Козлов получил национальную российскую награду им. Чумакова, международную премию Пола Харриса, Звезду Вернадского 1-й степени за вклад в развитие науки и медаль им. Мечникова.